Pelajar yang telah tamat pengajian menengah atas dan telah menduduki peperiksaan SPM boleh meneruskan pengajian ke tahap pendidikan tinggi.

Pengajian Tingkatan 6 mengambil masa dua tahun (Tingkatan 6 Bawah dan Tingkatan 6 Atas). Pelajar yang layak akan menerima surat tawaran dari Jabatan Pendidikan Negeri. Jurusan yang ditawarkan di Tingkatan 6 SMK Mutiara Rini ialah Jurusan Kemanusiaan sahaja. Terdapat tiga pakej mata pelajaran :

• Pakej 1 (Pengajian Am, Bahasa Melayu, Sejarah, Ekonomi dan MUET)

• Pakej 2 (Pengajian Am, Bahasa Melayu, Pengajian Perniagaan, Ekonomi dan MUET)

• Pakej 3 (Pengajian Am, Geografi, Seni Visual, Pengajian Perniagaan dan MUET)